(1)作為軟件得到重點(diǎn)保護(hù)的依據(jù)
《國務(wù)院關(guān)于印發(fā)鼓勵軟件產(chǎn)業(yè)和集成電路產(chǎn)業(yè)發(fā)展若干政策的通知》第三十二條規(guī)定：“國務(wù)院著作權(quán)行政管理部門要規(guī)范和加強(qiáng)軟件著作權(quán)登記制度，鼓勵軟件著作權(quán)登記，并依據(jù)國家法律對已經(jīng)登記的軟件予以重點(diǎn)保護(hù)。”
(2)減免稅收的依據(jù)
財(cái)政部、國家稅務(wù)總局《關(guān)于貫徹落實(shí)〈中共中央、國務(wù)院關(guān)于加強(qiáng)技術(shù)創(chuàng)新，發(fā)展高科技，實(shí)現(xiàn)產(chǎn)業(yè)化的決定〉有關(guān)稅收問題的通知》中對軟件產(chǎn)品的稅收優(yōu)惠有詳細(xì)的規(guī)定?？赊k理雙軟，減免增值稅和企業(yè)所得稅?？赊k理高新，減免企業(yè)所得稅。
(3)作為無形資產(chǎn)出資入股
《關(guān)于以高新技術(shù)成果出資入股若干問題的規(guī)定》規(guī)定計(jì)算機(jī)軟件可以作為高新技術(shù)出資入股，而且作價(jià)的比例可以突破公司法20%的限制達(dá)到35%?，F(xiàn)在有的地方更規(guī)定軟件可以作價(jià)100%以技術(shù)出資的規(guī)定。
(4)作為申請科技成果的依據(jù)
可作為高新企業(yè)認(rèn)定等重要的科技成果。科學(xué)技術(shù)部關(guān)于印發(fā)《科技成果登記辦法》的通知第八條規(guī)定：“辦理科技成果登記應(yīng)當(dāng)提交《科技成果登記表》及下列材料：（一）應(yīng)用技術(shù)成果：相關(guān)的評價(jià)證明（鑒定證書或者鑒定報(bào)告、科技計(jì)劃項(xiàng)目驗(yàn)收報(bào)告、行業(yè)準(zhǔn)入證明、新產(chǎn)品證書等）和研制報(bào)告；或者知識產(chǎn)權(quán)證明（專利證書、植物品種權(quán)證書、軟件登記證書等）和用戶證明?！边@里的登記可以理解為著作權(quán)的登記，其他部委也有類似規(guī)定，以軟件申請技術(shù)成果應(yīng)當(dāng)遞交軟件登記證書。
除此之外，軟件著作權(quán)登記還有更為現(xiàn)實(shí)的意義，就是享有軟件著作權(quán)證明作用。軟件由一系列的代碼組成，稱為源代碼，其可以無限制的復(fù)制。軟件著作權(quán)所保護(hù)的是源代碼。一般認(rèn)為誰持有源代碼，誰既是著作權(quán)人，由于源代碼的可復(fù)制性，不象復(fù)制紙質(zhì)材料那樣，可以區(qū)分原始與復(fù)制件，假使源代碼保密不嚴(yán)，就很難區(qū)分著作權(quán)人。如果盡早進(jìn)行著作權(quán)登記，取得《軟件著作權(quán)登記證書》，這就是初步的權(quán)利證明。在發(fā)生軟件著作權(quán)爭議時，是主張軟件權(quán)利的有力武器，而要證明《軟件著作權(quán)登記證書》并非真正軟件著作權(quán)人，在舉證上具有相當(dāng)難度。在進(jìn)行軟件著作權(quán)貿(mào)易時，《軟件著作權(quán)登記證書》有利于交易的順利完成。